全国畜牧总站是畜牧业管理的国家级技术支撑机构。主要职责如下：

　　（一）协助畜牧行政主管部门拟订畜牧业有关法律、法规和政策建议，受委托承担全国畜牧业管理的具体工作，提出行业重大技术进步措施建议。

　　（二）研究提出全国畜牧业技术推广规划和体系建设规划，指导全国畜牧业技术推广体系建设及推广机构的业务工作，组织开展全国畜牧业技术推广和专业技术人员培训，负责全国畜牧业职业技能鉴定工作。

　　（三）承担畜禽、牧草饲料品种资源的调查、保护与管理工作；组织实施相关品种的审定、登记、引进、繁育、推广工作。

　　（四）承担畜牧业产品质量相关标准和技术规范的拟订工作；推广畜禽健康饲养方式，承担养殖环境监测与监督管理工作。

　　（五）承担畜牧业统计和经济运行分析工作；承担畜产品加工业务指导工作，组织畜牧业技术合作与交流；开展畜牧业国际贸易相关政策、法规研究；参与协调国际贸易争端。

　　（六）承担畜牧业行政许可事项及国家级畜禽遗传资源保种场、保护区和基因库的审核工作；承担畜牧业项目相关管理工作。

　　（七）组织实施草场改良工作；承担草牧业监测的技术支持与服务工作。

　　（八）承担畜牧业相关技术委员会的日常工作。

　　（九）完成农业农村部交办的其他工作。